お客様のご質問で「表と裏でPDFファイルが2つあるのだけれど、合体して1つのPDFファイルにまとめないとダメですか？」というものがありました。
特売プレスの入稿では、特にPDFをひとつのファイルにまとめる必要はございません。
むしろ、PDF/X-1a形式で保存した複数のファイルをAcrobatなどで結合すると、保存方法によってはAcrobatの仕様によりPDF/X-1a形式ではなくなってしまう場合もありますのでご注意下さい。
もちろん、InDesignやWordなどのページの概念があるソフトウェアからPDFを作成する場合、1つのPDFファイルに複数ページが入っている状態になりますが、この状態でも問題はありません。ご入稿しやすい方法をお選び下さい。
https://www.ddc.co.jp/hatena/archives/20060619-170420.html