Adobeのサポートページで、Windows版Acrobat XIのトラブルについて掲載がありました。
内容としては『Century フォントを使用している PDF ファイルを印刷すると、一部の文字が欠けて表示されるなどの問題が発生』するそうです。
画面表示上では問題が無いPDFなのですが、印刷しようとすると文字が欠けたりするとのことです。
データに問題があるわけではありません。
Adobeのサポートページには一時的にこの問題を回避する方法が記載されています。
こうしたエラーに心当たりがある方は、一度Adobeのサポートページを確認されてはいかがでしょうか。